Иако су домени Бактерије, Археје и Еукарије засновани на генетским критеријуми , биохемијска својства такође указују на то да археје чине независну групу унутар прокариота и да деле особине и са бактеријама и са еукарионима. Главни примери ових особина укључују:
бактеријски ћелијски зид; пептидогликан Ћелијски зидови бактерија садрже пептидогликан. Висуалс Унлимитед / Т.Ј. Беверидге
афроамерички доприноси америчкој култури
мембрански липиди Бактерије и еукариоти производе мембранске липиде који се састоје од масних киселина повезаних естарским везама са молекулом глицерола. Енцицлопӕдиа Британница, Инц.
2. Масне киселине: бактерије и еукариоти производе мембрану липиди који се састоје од масних киселина повезаних естер везе са молекулом од глицерол . Супротно томе, археје имају етер везе које повезују масне киселине са молекулима глицерола. Иако неколико бактерија такође садржи епитере повезане липиде, нису откривене археје које садрже естре повезане липиде.3. Комплексност РНК полимеразе: транскрипцију унутар свих врста организама врши ензим зван РНК полимераза, који копира ДНК образац у РНК производ. Бактерије садрже једноставну РНК полимеразу која се састоји од четири полипептида. Међутим, и археје и еукариоти имају вишеструке РНК полимеразе које садрже вишеструке полипептиде. На пример, РНК полимеразе археја садрже више од осам полипептида. РНК полимеразе еукариота се такође састоје од великог броја полипептида (10–12), с тим што су релативне величине полипептида сличне величини хипертермофилне архејске РНК полимеразе. Према томе, архејске РНК полимеразе више личе на РНК полимеразе еукариота него на бактерије.
4. Синтеза протеина: разне карактеристике синтезе протеина у архејама сличне су карактеристикама еукариота, али не и бактерија. Истакнута разлика је у томе што бактерије имају иницијатор тРНК (трансфер РНА) која има модификовани метионин, док еукариоти и археје имају иницијатор тРНК са немодификованим метионином.
5. Метаболизам: разне врсте метаболизма постоје и у архејама и у бактеријама које не постоје у еукариотима, укључујући фиксирање азота , денитрификација, хемолитхотрофија и хипертермофилни раст. Метаногенеза (производња метана као нуспродукта метаболизма) јавља се само у домену Арцхаеа, тачније у пододељу Еуриарцхаеота. Класична фотосинтеза употреба хлорофила није пронађена ни у једној археји.
шта значи исламски појам хаџ
Сматра се да су метаболичке стратегије које археје користе изванредно разнолик у природи. На пример, изгледа да халофилне археје могу да успевају у високим солима окружења јер се у њима налази посебан скуп гена који кодирају ензиме за метаболички пут који ограничава осмозу. Тај метаболички пут, познат као пут метиласпартата, представља јединствени тип анаплерозе (процес допуњавања залиха метаболичких интермедијара; у овом случају интермедијар је метиласпартат). Халофилни архејци, који укључују Халоарцула марисмортуи , модел организма који се користи у научним истраживањима, сматра се да је стекао јединствени скуп гена за пут метиласпартата поступком познатим као хоризонтални пренос гена, у којем се гени преносе са једног врста ка другом.
